【ImageJ】2D stack画像の範囲を指定して複数スライスの画素値を置換する

Skull-san

今回は2D stack 画像の画素値を変更するマクロを紹介します。
それだけの記事です。

処理する画像は以下です。ImageJで開いておいてください。

内部の球の画素値を100から200に変更するのが目的です

処理する前に以下の情報について手元に用意してください。

置き換える前の画素値　
置き換えた後の画素値 　
処理する最初のスライス番号 　
処理する最後のスライス番号 　
処理範囲の開始点（X座標）　左上
処理範囲の開始点（Y座標）　左上
処理範囲の終了点（X座標）　右下
処理範囲の終了点（Y座標）　右下

マクロを新規で作成します。

以下のマクロをコピー＆ペーストしてください。

macro "Replace Pixel Value in Stack (with custom range)" {

    // 手入力でX（置き換えたい画素値）、Y（置き換える画素値）、およびスライス数を指定
    X = getNumber("Enter the pixel value to replace (X):", 0);
    Y = getNumber("Enter the new pixel value (Y):", 0);
    startSlice = getNumber("Enter the starting slice number:", 1);
    endSlice = getNumber("Enter the ending slice number:", 1);
    
    // 範囲を指定するため、左上と右下の座標を入力
    x1 = getNumber("Enter the top-left x-coordinate:", 0);
    y1 = getNumber("Enter the top-left y-coordinate:", 0);
    x2 = getNumber("Enter the bottom-right x-coordinate:", 0);
    y2 = getNumber("Enter the bottom-right y-coordinate:", 0);

    // スタックの各スライスに対して処理を実行
    for (i = startSlice; i <= endSlice; i++) {
        setSlice(i);  // i番目のスライスに移動

        // 指定された範囲内のピクセル値を置換
        for (y = y1; y <= y2; y++) {
            for (x = x1; x <= x2; x++) {
                v = getPixel(x, y);
                if (v == X) {
                    setPixel(x, y, Y);
                }
            }
        }
        // スライスを更新
        updateDisplay();
    }

    // 処理完了メッセージ
    showMessage("Pixel value replacement complete!");
}

対象の画像がアクティブになっている状態でRunを押します。

これで対象とした画素値が変換されます。
ぜひご利用ください。

Skull-san

今回はこれだけ！